En Editar > Opciones, pestaña General se elige la base de datos que se utiliza.
Ver el archivo adjunto 351994
Si seleccionas la predeterminada irá a buscarlos donde están ahora
Pregunta, que versión de BaseCamp tienes instalada? la 4.7?
Pues conseguido, mil gracias Luki. Estaba acojonado pensando que lo había perdido todo.
Ya estaba seleccionada la opción "Predeterminado", pero por algún motivo se había borrado la ubicación del directorio de la base de datos y Basecamp no la encontraba. Le he indicado de nuevo la ubicación y ya se ha recuperado todo.

Y sí, la versión que tengo instalada es la 4.7