Si las has conseguido cargar por la toma de conexión con el mantenedor de baterías no la tienes dañada. Si no carga por la toma y has tenido que ir a los bornes en principio tampoco, ya que como comentas aun giraba algo el motor.
Si te fijas en el manual (ya que como dice Calcatoupeiras la tuya es el modelo 2021) pone que te desconecta las tomas, los puños y el asiento calefactable en marcha si detecta que la batería no tiene carga suficiente. Debería desconectar la radio también. Más que el precio de una batería que no tienes por que cambiarla nunca antes de 5 años mínimo, es la faena de dejarte tirado, y como comentabas gracias que te pillo en casa, sino llamar a asistencia y esperar a que te vengan con el arrancador, todo por no modificar software para que desconecte, supongo que bmw lo hará en futuras actualizaciones.
Aún así, no lo entiendo, llevan ya no sé cuantas actualizaciones. Los modelos 2014 en adelante casi seguro que desconectan, a ver si los que la tengan nos dicen algo